Nella città di Crystal Cove, nota come "la città più infestata al mondo", Scooby-Doo e i suoi amici Fred, Daphne, Velma e Shaggy affrontano misteri inquietanti. Mentre risolvono enigmi soprannaturali, scoprono un oscuro segreto nascosto sotto la città, legato a una precedente squadra di investigatori scomparsa. Tra avventure pericolose e dinamiche personali, il gruppo si avvicina sempre più alla verità, sfidando forze oscure che minacciano Crystal Cove.